Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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