Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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