Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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