Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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