Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN1Q14699 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms