Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CDH18Q13634 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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CDH18Q13634 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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CDH18Q13634 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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CDH18Q13634 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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