Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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