Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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