Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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