Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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