Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF1Q13291 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms