Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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SEMA3BQ13214 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SEMA3BQ13214 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SEMA3BQ13214 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SEMA3BQ13214 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SEMA3BQ13214 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SEMA3BQ13214 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SEMA3BQ13214 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SEMA3BQ13214 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SEMA3BQ13214 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SEMA3BQ13214 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SEMA3BQ13214 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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