Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
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