Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF2Q12947 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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