Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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FOXF1Q12946 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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