Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
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