Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EP300Q09472 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EP300Q09472 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EP300Q09472 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EP300Q09472 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EP300Q09472 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EP300Q09472 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EP300Q09472 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EP300Q09472 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EP300Q09472 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EP300Q09472 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EP300Q09472 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EP300Q09472 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EP300Q09472 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EP300Q09472 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EP300Q09472 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EP300Q09472 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EP300Q09472 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EP300Q09472 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EP300Q09472 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EP300Q09472 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms