Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms