Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms