Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms