Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms