Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms