Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms