Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms