Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMF1P82094 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMF1P82094 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMF1P82094 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMF1P82094 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMF1P82094 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMF1P82094 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMF1P82094 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMF1P82094 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMF1P82094 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMF1P82094 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMF1P82094 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMF1P82094 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMF1P82094 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMF1P82094 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMF1P82094 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMF1P82094 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMF1P82094 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMF1P82094 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMF1P82094 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMF1P82094 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMF1P82094 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms