Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms