Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPK4P57078 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms