Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
THOP1P52888 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
THOP1P52888 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
THOP1P52888 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
THOP1P52888 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
THOP1P52888 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms