Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms