Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLK1P49759 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLK1P49759 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLK1P49759 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLK1P49759 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLK1P49759 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLK1P49759 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLK1P49759 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms