Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTCFP49711 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTCFP49711 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTCFP49711 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTCFP49711 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTCFP49711 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms