Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTPAP49638 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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TTPAP49638 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TTPAP49638 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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