Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCLCP48506 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCLCP48506 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCLCP48506 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCLCP48506 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCLCP48506 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLCP48506 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLCP48506 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLCP48506 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLCP48506 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLCP48506 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLCP48506 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCLCP48506 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCLCP48506 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCLCP48506 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLCP48506 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLCP48506 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms