Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBRP36941 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LTBRP36941 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LTBRP36941 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LTBRP36941 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LTBRP36941 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBRP36941 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LTBRP36941 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBRP36941 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBRP36941 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms