Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms