Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms