Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP6P35125 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP6P35125 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
USP6P35125 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP6P35125 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP6P35125 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP6P35125 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
USP6P35125 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP6P35125 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP6P35125 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP6P35125 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP6P35125 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms