Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPS1P31327 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CPS1P31327 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CPS1P31327 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPS1P31327 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPS1P31327 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPS1P31327 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CPS1P31327 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPS1P31327 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPS1P31327 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPS1P31327 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPS1P31327 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPS1P31327 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CPS1P31327 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPS1P31327 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPS1P31327 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPS1P31327 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms