Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA6P31267 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms