Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXD3P31249 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HOXD3P31249 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HOXD3P31249 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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