Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms