Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A5P29400 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms