Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXP28300 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXP28300 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXP28300 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXP28300 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXP28300 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXP28300 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXP28300 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXP28300 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXP28300 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms