Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD1P17405 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms