Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms