Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms