Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1P11387 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1P11387 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP1P11387 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP1P11387 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP1P11387 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP1P11387 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP1P11387 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1P11387 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms