Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms