Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NGFRP08138 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NGFRP08138 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NGFRP08138 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms