Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBE1P02100 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBE1P02100 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBE1P02100 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBE1P02100 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBE1P02100 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBE1P02100 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBE1P02100 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBE1P02100 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms